驯服系统是游戏生存机制的核心环节，主要分为击晕驯服与和平驯服两类。击晕驯服适用于绝大多数生物，需使用麻醉箭、麻醉镖等武器削弱目标至昏迷状态，随后向其物品栏投入对应食物；和平驯服则针对特定被动型生物，需佩戴驱虫剂接近并直接投喂所需资源。驯服效率与生物等级、食物品质直接相关，高效饲料可大幅缩短进程，其配方需通过烹饪锅或工业大锅合成，例如狮鹫蛋配合优质熟肉可驯服独角兽，梁龙蛋则是异特龙的关键饲料。
基础阶段需制作弹弓、麻醉箭及流星锤控制小型生物，后期则依赖长管步枪与强力麻醉剂应对大型掠食者。饲料制作需解锁烹饪设备：简易烹饪锅需石头、茅草等基础材料，工业大锅则依赖聚合物、水泥等高级资源。驯服过程中需持续监测生物眩晕值，通过强制喂食麻醉药或黑果子维持昏迷状态，同时优先投喂专属饲料提升进度，次选方案为紫色浆果或生肉。
伪齿鸟等海岸生物需在浅海区域投喂鱼肉，沧龙、蛇颈龙等深海巨兽则需驾驶木筏引至浅水区卡位击晕。夜行性生物如斑龙在白天处于虚弱状态，驯服风险更低；厚鼻龙可释放化学物质改变周围生物攻击性，需优先清除其护卫种群。飞行生物如古神翼龙需借助爪钩固定，水生生物则依赖潜水装备与麻醉鱼叉。
地牢生物如凶齿豨需通过芯片复活再击晕驯服；水龙兽、麝足兽等和平驯服型生物仅接受浆果投喂；电鳗需穿戴绝缘护甲贴近投喂生羊肉；甲壳类生物如古马陆要求驯服者提前涂抹驱虫剂。生物巢穴位置直接决定资源获取效率，例如玛瑙螺分泌的水泥粘液是高级建筑的关键材料。完整驯服流程包含击晕控制、食物供给、眩晕维持与保护机制四阶段。击晕后需在生物物品栏放入驯养食物，通过麻醉物维持昏迷状态直至驯养条满格。驯服期间需建立木质拒马或石制围墙隔绝外部威胁，尤其针对高价值生物。驯化完成后需配置鞍具实现骑乘，不同鞍具解锁等级与制作材料差异显著，例如风神翼龙鞍需大量兽皮与纤维。
